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<div class="csl-entry">Zehetner, L. (2021). <i>Metagenome analysis of the rhizobiome of Dactylorhiza traunsteineri</i> [Diploma Thesis, Technische Universität Wien]. reposiTUm. https://doi.org/10.34726/hss.2021.86948</div>
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dc.identifier.uri
https://doi.org/10.34726/hss.2021.86948
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dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/20.500.12708/18395
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dc.description
Zusammenfassung in deutscher Sprache
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dc.description
Abweichender Titel nach Übersetzung der Verfasserin/des Verfassers
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dc.description.abstract
Secondary metabolites, such as antibiotics, antioxidants, or other bioactive substances are mainly produced by microorganisms. Genes involved in the production of secondary metabolites in microorganisms are often found clustering together as Biosynthetic gene clusters (BGC), containing the genes for the synthesis of a specific secondary metabolite. To investigate potential BGCs the metagenome of the rhizosphere associated with Dactylorhiza traunsteineri was sequenced, assembled, binned and genes were preliminary predicted. The first aim of my work is to analyze the annotated BGCs containing genes that could be involved in the biosynthesis of unknown bioactive metabolites. Secondly, metagenomic analyses will be performed to predict the potential of the whole population as well as interactions. A third target includes the phylogenetic prediction of the involved organisms for a better understanding of the metagenome. I will use several bioinformatic tools to achieve the aims of this project. Based on the success of my work, future colleagues can express the selected BGCs in model organisms and bioactive secondary metabolites can be investigated.
en
dc.description.abstract
Sekundärmetabolite, wie Antibiotika, Antioxidantien oder andere bioaktive Substanzen werden hauptsächlich von Mikroorganismen produziert. Gene, die in deren Produktion involviert sind, werden oft in Biosynthetischen Genclustern (BGC) organisiert vorgefunden. Die Gene eines BGC dienen der Synthese spezifischer Sekundärmetabolite. Um bisher unbekannte BGCs zu entdecken, wurde das Metagenom der Rhizosphere, assoziiert mit Dactylorhiza traunsteineri, sequenziert, assembliert, gebinnt und die Gene prognostiziert. Das erste Ziel meiner Arbeit ist die Analyse und Selektion annotierter BGCs, die unbekannte Gene beinhalten und möglicherweise in die Synthese von bioaktiven Substanzen involviert sind. Als zweites werde ich eine Metagenomanalyse durchführen, um das Potential der Gesamtpopulation und mögliche Interaktionen abschätzen zu können. Das dritte Ziel ist die phylogenetische Analyse der untersuchten Organismen zum besseren Verständnis des Metagenoms.
de
dc.language
English
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dc.language.iso
en
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dc.rights.uri
http://rightsstatements.org/vocab/InC/1.0/
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dc.subject
Sekundärmetaboliten
de
dc.subject
Biosynthetische Gencluster
de
dc.subject
Metagenom einer Rhizosphere
de
dc.subject
Dactylorhiza traunsteineri
de
dc.subject
Secondary metabolites
en
dc.subject
Biosynthetic gene clusters
en
dc.subject
Metagenome of a rhizosphere
en
dc.subject
Dactylorhiza traunsteineri
en
dc.title
Metagenome analysis of the rhizobiome of Dactylorhiza traunsteineri
en
dc.title.alternative
Metagenomanalyse des Rhizobioms von Dactylorhiza traunsteineri
de
dc.type
Thesis
en
dc.type
Hochschulschrift
de
dc.rights.license
In Copyright
en
dc.rights.license
Urheberrechtsschutz
de
dc.identifier.doi
10.34726/hss.2021.86948
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dc.contributor.affiliation
TU Wien, Österreich
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dc.rights.holder
Leopold Zehetner
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dc.publisher.place
Wien
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tuw.version
vor
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tuw.thesisinformation
Technische Universität Wien
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dc.contributor.assistant
Vignolle, Gabriel Alexander
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tuw.publication.orgunit
E166 - Institut für Verfahrenstechnik, Umwelttechnik und technische Biowissenschaften