Title: Electrophoretic analysis of glycoproteins and their interactions with lectins studied by means of microchip capillary electrophoresis in the liquid phase and of gas-phase electrophoretic molecular mobility analyzer at atmospheric pressure
Other Titles: Biopolymer- und Nanopartikeltrennung basierend auf elektrophoretischer Mobilitaet in der Gasphase und Fluessigphase
Language: English
Authors: Engel, Nicole Yvonne 
Qualification level: Doctoral
Advisor: Allmaier, Günter 
Assisting Advisor: Marchetti-Deschmann, Martina  
Issue Date: 2017
Number of Pages: 142
Qualification level: Doctoral
Abstract: 
Glykosilierungen zählen zu den häufigsten, gleichzeitig aber auch zu den komplexesten co- und posttranlationalen Modifikationen. Ihre hohe strukturelle und funktionale Vielfalt stellt eine große Herausforderung für viele Analysemethoden dar. Oftmals werden Lektine für eine gezielte Glykoproteinanreicherung, -detektion und -charakterisierung eingesetzt, da sie spezifisch Glykanstrukturen binden. Im Rahmen dieser Arbeit wurden sowohl intakte Glykoproteine als auch deren Wechselwirkungen mit Lektinen qualitativ und quantitativ mittels elektrophoretischen Trennungen in flüssiger und gasförmiger Phase untersucht. In flüssiger Phase konnte das Potential von Kapillargelelektrophorese am Mikrochip (MCGE) im Vergleich zu Natriumdodecylsulfat-Polyacrylamidgelelektrophorese (SDS-PAGE) hinsichtlich Schnelligkeit, Probenverbrauch, Reproduzierbarkeit und Genauigkeit in der Quantifizierung aufgezeigt werden. Eine Kombination von MCGE mit vorheriger Lektinaffinitätsanreicherung an magnetischen Beads ermöglichte zudem die selektive Untersuchung von Glykoproteinen aus komplexen biologischen Proben wie humanem Serum und Trichoderma atroviride Myzeliumextrakten. Daneben wurde mit diesem Ansatz eine unspezifische Wechselwirkung zwischen den magnetischen Beads und der biologischen Probe nachgewiesen, die für eine Datenevaluierung von spezifischen Anreicherungen berücksichtig werden muss. Glykoproteine und Lektine sowie deren Interaktion wurden zudem in der Gasphase mit einem Nanoelektrospray (nES) basierenden Ionenmobilitätsspektrometer (gas-phase electrophoretic mobility molecular analyzer, GEMMA) untersucht. Da das System unter Atmosphärendruck und mit nicht-reduzierenden Elektrolytlösungen arbeitet, konnten sogar die nur schwach wechselwirkenden, nichtkovalenten Lektin-Glykoprotein-Komplexe in ihrer nativen biologischen Form untersucht werden. Interaktionsstudien erlaubten Rückschlüsse auf die Bindungsspezifitäten und -affinitäten der verwendeten Lektine gegenüber den untersuchten Glykoproteinen. Neben der bloßen Detektion konnten die biospezifischen Komplexe mit nES GEMMA auch betreffend ihrer Durchmesser als trockene Nanopartikel bestimmt werden. Weiterhin konnten diese nach der elektrophoretischen Trennung auf einer Nitrozellulosemembran gesammelt und die Aufrechterhaltung ihrer nativen Struktur mittels anschließendem immunologischem Assay belegt werden. Das nES GEMMA-System liefert daher einen vielversprechenden Ansatz für die Analyse von schwachen Lektin-Glykoprotein-Interaktionen.

Glycosylations are considered the most abundant, but also the most complex form of co- and post-translational modifications. Their huge structural and functional diversity renders their analysis rather challenging, as addressed by the present thesis with the validation of two new analytical methods focussing on the electrophoretic separation of glycoproteins in liquid- and gas-phase. Therefore, intact glycoproteins as well as their interactions with lectins were qualitatively and quantitatively investigated by microchip capillary gel electrophoresis (MCGE) and on a nano electrospray gas-phase electrophoretic mobility molecular analyzer (nES GEMMA) instrument. For glycoprotein analysis MCGE demonstrated high sensitivities, high accuracy in quantitation, and a high reproducibility in sizing, i.e. molecular weight (MW) determination. This makes it a good rapid and easy-to-use alternative to the more elaborate sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). Deviations in sizing could be observed with both techniques, SDS-PAGE and MCGE, in comparison to mass spectrometric-derived values. Especially in the case of MCGE, they increased in accordance to the degree of glycosylation. Nevertheless, the combination of MCGE with magnetic bead-based lectin affinity enrichment enabled the targeted analysis of glycoproteins from complex biological samples with high selectivity. Validation of the developed strategy with human serum and mycelia extract of the fungus Trichoderma atroviride demonstrated the selective enrichment of glycoproteins. However, the existence of an unspecific binding between the sample and the beads themselves was revealed, too. Affecting glycoproteins, these unspecific interactions can challenge any lectin-based specificity experiment. SDS-PAGE analysis followed by a proteomic approach revealed these results and enabled in addition the identification of two putative glycoproteins for the only fairly studied glycoproteome of Trichoderma atroviride. Based on a size / MW correlation nES GEMMA, on the other hand, allowed MW determinations of the employed glycoproteins and lectins in very good agreement to mass spectrometric values. Operating at ambient pressure and with non-denaturing electrolyte solutions, the system even enabled the analysis of the weak lectin-glycoprotein interactions while maintaining the biological structure of the complex. Interaction studies were performed in regard to binding specificities and affinities towards selected glycoproteins. Results were additionally compared to capillary electrophoresis-on-a-chip-derived data. Next to mere detection, the non-covalent biospecific complex after size-separation could also be sampled onto nitrocellulose membrane with the nES GEMMA device. Subsequent identification by an immunological assay further proved the intact native structure of the analytes throughout the nES process, the gas-phase separation, and even the electrostatic sampling. Consequently, nES GEMMA is a promising platform for the analysis of the weak glycoprotein-lectin interactions specifically with a straightforward sample preparation, a label-free and chemical-nature independent detection, and a simplified data interpretation as only singly charged species are regarded.
Keywords: Analytische Chemie; Instrumentelle Analytische Chemie; Glykoprotein; Elektrophoretische Trennung
Analytical Chemistry; instrumental Analytical Chemistry; Glycoprotein; Electrophoretic separation
URI: https://resolver.obvsg.at/urn:nbn:at:at-ubtuw:1-97178
http://hdl.handle.net/20.500.12708/1598
Library ID: AC13684255
Organisation: E164 - Institut für Chemische Technologien und Analytik 
Publication Type: Thesis
Hochschulschrift
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