A portable project management system for biological data analysis using Web services

Abstract

Die Analyse biologischer Datensätze ist oftmals komplex und besteht aus einer Vielzahl an einzelnen Analyseschritten.<br />Dementsprechend hoch ist der Anspruch an die verwendeten Analysewerkzeuge, wo man zunehmend auf die Flexibilität von Workflowsystemen vertraut um komplexe Analysefolgen als sogenannte Analysepipelines abzubilden. Dieser Entwicklung zum Trotz gibt es vergleichsweise wenig neue Ansätze zur Strukturierung, Integration und Verwaltung des Analysedatenflusses. Im Rahmen dieser Diplomarbeit wurde eine generisches Datenverwaltungsframework (Portable Projekt-Management-System) entwickelt, das Analysedaten mitloggen, automatisch strukturieren und verwalten kann mit dem Ziel, einer lückenlosen Erfassung des gesamten Datenstroms komplexer Analysen.

Analysis of biological data is complex and requires highly flexible analysis tools. Each of these tools generates vast amounts of biological data. In spite of recent advances in workflow based data analysis, little effort has been made in the development of new mechanism for the automated storage, integration and management of the flow of analysis data. The aim of this work is to develop a data management framework (Portable Project Management System) that is optimized to manage, store, integrate and secure the data stream generated during entire analysis processes. A complete recording of the processes is of very high scientific importance.