Title: Intact cell mass spectrometry of mycotoxin-producing Fusarium fungi for differentiation and protein identification
Language: English
Authors: Dong, Hongjuan 
Qualification level: Doctoral
Keywords: Intact Cell; Spore Massenspektrometrie; ICMS; ISMS; Fusarium; Fungi; matrix-unterstützter Laserdesorption ionisation und linearer Flugzeitmassenspektrometrie; MALDI
Advisor: Allmaier, Günter 
Assisting Advisor: Schuhmacher, Rainer
Issue Date: 2010
Number of Pages: 99
Qualification level: Doctoral
Abstract: 
Schnelle und zuverlässige Identifizierung von Mikroorganismen wie Bakterien oder Pilzen ohne umfangreiche Probenvorbereitung ist von großer bedeutung im Bereich der Industrie, der Landwirtschaft und der Gesundheit. Die konventionellen Techniken wie Polymerase-Kettenreaktion (PCR) oder klassische mikrobiologische Methoden sind sehr zeitaufwendig und arbeitsintensiv. Des Weiteren führen sie oft nicht zu eindeutigen Resultaten. Die direkt Oberflächenproteinmusterbestimmung von Mikroorganismen durch "Intact Cell/Spore Massenspektrometrie (ICMS/ISMS) basierend auf matrix-unterstützter Laserdesorption/Ionisation und linearer Flugzeitmassenspektrometrie (MALDI LTOF MS) stellt eine alternative Methode dar, die für die Erfüllung dieser Aufgabe geeignet erscheint. Der Schwerpunkt der vorliegenden Arbeit liegt in der Weiterentwicklung eines Probenvorbereitungsprotokolls für die Zwecke der Differenzierung und Identifizierung von Fusarium Spezies und Isolaten, die Mykotoxine produzieren, mit Hilfe der MALDI LTOF MS (IC-MS).

Rapid and reliable differentiation and identification of microorganisms such as bacteria or fungi without extensive sample handling is of great importance in the field of industry, agriculture and public health. However, the conventional technique like polymerase chain reaction (PCR) or polymorphisms normally are time consuming and labor intensive. Direct profiling of microorganisms by intact cell/spore mass spectrometry (ICMS/ISMS) based on matrix-assisted laser desorption/ionization linear time-of-flight mass spectrometry (MALDI LTOF MS) provided an alternative research tool which is capable of fulfilling the mentioned tasks. The main focus of the present work is the further development of a sample preparation protocol on the purpose of identifying and differentiating mycotoxin-producing fungi with the focus on Fusarium species by intact cell MALDI LTOF MS (IC-MS).
URI: https://resolver.obvsg.at/urn:nbn:at:at-ubtuw:1-32687
http://hdl.handle.net/20.500.12708/13134
Library ID: AC07806951
Organisation: E164 - Institut für Chemische Technologien und Analytik 
Publication Type: Thesis
Hochschulschrift
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